Sygnatura chemiczna to potężne narzędzie, które może dostarczyć informacji o lotnych biomarkerach różnych chorób. Celem tej części badań była identyfikacja potencjalnych lotnych biomarkerów raka żołądka. Aby zwiększyć wiarygodność uzyskanych wyników do badań włączono dwie odrębne grupy pacjentów z Łotwy i Ukrainy. Analiza metabolicznego odcisku stopy próbek żołądka analizowano na podstawie dwóch odrębnych populacji przy użyciu metody chromatografii gazowej sprzężonej ze spektrometrią masową. Po uwzględnieniu związków będących zanieczyszczeniami badanych próbek (np. związanych ze środowiskiem szpitalnym i ich metabolitów (np. sewofluran, czy propofol), dziesięć LZO, tj. 2-butanon, benzaldehyd, n-pentan, toluen, disiarczek węgla, benzonitryl, 2-pentanon, aceton, etanol oraz octan etylu występowało z częstością ponad 80% w obu rodzajach tkanek. Ponadto pirydyna i 1-propanol pojawiały się z powyższą częstością w tkankach nowotworowych, podczas gdy w próbkach tkanek zdrowych próg ten został przekroczony przez acetoinę i 2,3-butanedion. Spośród zidentyfikowanych analitów dziewiętnaście wykazało różnice w stężeniach w fazie nadpowierzchniowej badanych tkanek. W przypadku jedenastu LZO zaobserwowano obniżoną emisję z tkanki nowotworowej, a osiem LZO było emitowanych w większych ilościach przez ten typ tkanki. Wśród pacjentów z Ukrainy izopren wykazywał zwiększoną emisję w przypadku tkanek nowotworowych, natomiast w przypadku pacjentów z Łotwy zauważono odwrotną relację. Pirydyna wykazywała podwyższoną emisję w tkankach nowotworowych w porównaniu z normalnymi w obu grupach pacjentów. Wyniki uzyskane w trakcie przeprowadzonych badań świadczą o tym, że lotną frakcję metabolomu może charakteryzować znacząca zmienność pomiędzy populacjami pacjentów. Dlatego też badania nad lotnymi znacznikami chorób nowotworowych obejmujące grupy pacjentów z jednej populacji, czy ośrodka mogą być niewystarczające. Kolejnym ważnym aspektem jest włączenie do badań pacjentów z różnych lokalizacji geograficznych.
Dane badawcze zostały wykorzystane w artykule: Mochalski P.; Leja M.; Ślefarska-Wolak D.; Mezmale L.; Patsko V.; Ager C.; Królicka A.; Mayhew C.A.; Shani G.; Haick H. Identification of Key Volatile Organic Compounds Released by Gastric Tissues as Potential Non-Invasive Biomarkers for Gastric Cancer. Diagnostics 2023, 13, 335. DOI: 10.3390/diagnostics13030335. ; Programy, w jakich analizowano dane: Agilent MassHunter Unknowns Analysis, Agilent MassHunter Quantitative Analysis
Dziedzina nauk ścisłych i przyrodniczych
Wydział Nauk Ścisłych i Przyrodniczych
Licencja Creative Commons Przekazanie do Domeny Publicznej (CC0 1.0)
Narodowe Centrum Nauki (2021/41/N/ST4/02307)
Aug 7, 2024
Mar 28, 2023
31
https://repozytorium.ujk.edu.pl/publication/9270
Edition name | Date |
---|---|
Tissue dzień 3b | Aug 7, 2024 |