Obiekt

Abstrakt:

Badania in vitro mogą pomóc w ujawnieniu ścieżek biochemicznych leżących u podstaw pochodzenia lotnych wskaźników licznych chorób. Głównym celem badań była identyfikacja potencjalnych biomarkerów raka żołądka. W tym celu zbadano lotne sygnatury dwóch linii komórkowych raka żołądka: AGS (gruczolak żołądka) i SNU-1 (gruczolak żołądka) oraz jednej linii komórkowej nabłonka żołądka (GES-1). W analizach zastosowano metodę GC-MS, aby dokładnie określić zmiany w metabolizmie komórek wywołane przez nowotwór. Dziesięć LZO było metabolizowanych (sześć aldehydów, dwa związki heterocykliczne oraz jeden keton i jeden ester), a trzydzieści pięć emitowanych (dwanaście ketonów, osiem alkoholi, sześć węglowodorów oraz odpowiednio trzy etery, estry i związki aromatyczne) przez badanie linie. Stwierdzono, że linia komórkowa SNU-1 ma odmienny metabolizm w porównaniu do komórek zdrowych GES-1. Objawiało się to zmniejszoną produkcją alkoholi i ketonów oraz zwiększoną emisją estrów. Komórki AGS wykazywały zwiększoną produkcję metyloketonów zawierających nieparzystą liczbę atomów węgla, mianowicie 2-tridekanonu, 2-pentadekanonu i 2-heptadekanonu. Badanie to dostarcza dowodów na to, że stan nowotworowy modyfikuje sygnaturę chemiczną ludzkich komórek. Istotną zaletą powyższych analiz jest sposób przeprowadzenia analiz składający się z pomiarów badanych linii komórkowych w trzech seriach przy równoczesnym przeprowadzeniu czterech niezależnych eksperymentów. Dodatkowo zewnętrzne czynniki zakłócające takie jak m.in. pokarm, leczenie, palenie tytoniu, mikrobiota, czy absorbowane z otoczenia lotne związki organiczne istotne w przypadku innych materiałów biologicznych jak mocz, oddech, czy próbki tkanek mogły być całkowicie wykluczone przy zastosowaniu badań in vitro.

Uwagi:

Dane badawcze zostały wykorzystane w artykule: Ślefarska-Wolak D.; Heinzle C.; Leiherer A.; Ager, C.; Muendlein A.;Mezmale L.; Leja M.; Corvalan A.H.; Drexel H.; Królicka A.; Shani G.; Mayhew C.A.; Haick H.; Mochalski P. Volatilomic Signatures of AGS and SNU-1 Gastric Cancer Cell Lines. Molecules 2022, 27, 4012. DOI: 10.3390/molecules27134012. ; Programy, w jakich analizowano dane: Agilent MassHunter Unknowns Analysis, Agilent MassHunter Quantitative Analysis

Data utworzenia:

2021-2022

Język:

angielski

Dziedzina nauki:

Dziedzina nauk ścisłych i przyrodniczych

Dyscyplina naukowa:

Nauki chemiczne

Wydział:

Wydział Nauk Ścisłych i Przyrodniczych

ORCID:

0000-0001-8601-876X

Prawa dostępu:

otwarty dostęp

Licencja:

Licencja Creative Commons Przekazanie do Domeny Publicznej (CC0 1.0)

Typ publikacji:

dane badawcze

Stan publikacji:

niepublikowana

Źródło finansowania:

Narodowe Centrum Nauki (2021/41/N/ST4/02307)